Ce taxon est aujourd'hui obsolète.Dénomination actuelle: Mucoromyceta, Zoopagomyceta et Basidiobolomyceta.
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Zygomycota
Le sporocyste de Phycomyces sporangium supporté par son sporocystophore
Les Zygomycètes sont un groupe polyphylétique de champignons, qui formait traditionnellement la division des Zygomycota. Ils doivent leur nom à leur mode de reproduction sexuée, qui se fait par cystogamie avec formation de zygospores (du grec ancienzugos = couple).
Les études de phylogénétique moléculaire du début du XXIesiècle ont conduit à abandonner ce taxon qui était composé de plusieurs lignées évolutives distinctes. Ses membres ont été répartis entre deux groupes principaux, considérés depuis 2018 comme des sous-règnes à parts entières, les Mucoromyceta et les Zoopagomyceta. La position des Basidiobolomycètes dans cette classification révisée est controversée, mais ils pourraient constituer une troisième branche distincte, les Basidiobolomyceta.
Description
Très discrets et de taille le plus souvent microscopique, ce sont des champignons à spores dépourvues de flagelles, dans lesquels les cellules ne sont pas séparées par des cloisons, leurs hyphes étant cœnocytiques ou siphonnés, avec de nombreux noyaux dans un même siphon. Ces champignons sont également caractérisés par une abondante reproduction asexuée et une croissance rapide qui leur permettent de coloniser rapidement leur milieu.
Subdivisions
Les Glomales, précédemment placées dans les Zygomycota, sont aujourd’hui réparties en quatre ordres et classées dans la division des Glomeromycota[1].
Les autres organismes autrefois inclus dans la division des Zygomycota ont été en 2007 répartis dans quatre sous-divisions non classées dans une division[1]. Benny publie en 2012 une synthèse sur les Zygomycota en reconnaissant neuf ordres [2]:
et deux ordres classés par divers auteurs dans les Trichomycetes:
les Asellariales
les Harpellales
Plus anciennement, on distinguait trois grands ordres dans la classe (paraphylétique) des zygomycètes stricto sensu (Zygomycetes)[3],[4]:
les Mucorales: parfois parasites de l’homme (agents de zygomycoses), ce sont le plus souvent des moisissures, dans bien des cas précieux auxiliaires de l’industrie chimique ou pharmaceutique. Quelques genres: Mucor (nombreuses espèces dont le «poil de chat» des fromages), Absidia, Rhizopus;
les Endogonales: abondants dans les sols, ils vivent en symbiose (partenaires endomycorhiziens) avec de nombreuses plantes supérieures, jouant un rôle important dans l’équilibre biologique de certains biotopes;
les Entomophthorales: parasites de plantes et d’animaux, parfois utilisés dans la lutte biologique contre des insectes nuisibles.
La classe des trichomycètes (Trichomycetes) regroupait les ordres suivants[5],[6]:
les Amoebidiales;
les Asellariales (entomogènes, parasites d’insectes);
les Eccrinales;
les Genistellales
les Harpellales (parasites);
les Kickxellales (saprophytes);
les Dimargaritales (parasites) qui présentent des septae avec des pores particuliers, les pores lenticulaires.
Les analyses actuelles montrent les Zygomycota comme étant polyphylétiques[2].
Les Amoebidiales et Eccrinales ont pris place au sein des Mésomycétozoaires, proches de la divergence entre Champignons et Animaux mais plus près de ces derniers[7],[8].
Les autres Trichomycètes, aujourd'hui dénommés Kickxellomycotina, restent sans doute proches des Endogonales et Entomophthorales[9].
Les Mucoromycotina sont peut-être plus proches parents des Gloméromycètes et des «Champignons supérieurs» que des autres Zygomycètes[9].
Le terme de zygomycètes a été introduit en 1954 comme «Phylum des zygomycètes» par Moreau, Les Champignons2, p.2035 (1954) [sans diagnose latine, type non désigné].
Son orthographe fut corrigée en «Zygomycota Moreau» par Whittaker, Science163, p.155 (1969) [Sans diagnose latine]; et par Cavalier-Smith, BioSystems14, p.463 (1981) [sans description].
Phylum actuel: Zygomycota Moreau, Les Champignons2, p.2035 (1954).
Le terme de trichomycètes a été introduit, à un rang non spécifié entre ascomycètes (Ascomycetes) et laboulbéniomycètes (Laboulbeniomycetes), en 1948 par Duboscq, Léger & Tuzet, Arch. Zool. Exp. Gén.86, p.29-144 (1948) [sans diagnose latine, type non désigné], puis par Manier (1955) au rang d’embranchement (ou phylum).
Le taxon a été validement publié au niveau de classe Trichomycetes par Alexopoulos, Introductory Mycology, p.37 (1962).
NB. Le phylum Trichomycota R.T. Moore, a également été proposé in Hawksworth (ed.), The Identification and Characterization of Pest Organisms, p.250 (1994).
Pathologie
En pathologie humaine, les zygomycètes sont à l'origine des mucormycoses (ou zygomycoses), principalement dues aux Mucorales.
Notes et références
(en) David S. Hibbett, Manfred Binder, Joseph F. Bischoff, Meredith Blackwell, Paul F. Cannon, Ove E. Eriksonet al., «A higher-level phylogenetic classification of the Fungi», Mycological Research, Elsevier, no111, , p.509-547 (lire en ligne[archive du ][PDF])
(en) Gerald L. Benny, «Current systematics of Zygomycota with a brief review of their biology», dans J.K. Mishra, J.P. Tewari et S.K. Deshmukh (éditeurs), Systematics and evolution of Fungi, Science Publishers, , 412p. (ISBN978-1-57808-723-5, lire en ligne), p.55-106
Les Sciences encyclopédie Alpha fascicule 5 chapitre Zygomycètes, page 138 à 140, directrice de rubrique Jacqueline Nicot 1974 édition Grange Batelière Paris
(en) B. Kendrick, The whole fungus. The sexual-asexual synthesis, vol.2,
Encyclopædia Universalis article phycomycètes, auteur de la rubrique Jacqueline Nicot 2012 édition 2012
Leger, Tuzet et Duboscq, Contribution à la connaissance des eccrinides: les trichomycètes.,
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