Le virus de l'encéphalite japonaise est un virus à ARN monocaténaire de polarité positive (groupe IV de la classification Baltimore) appartenant au genre Flavivirus, de la famille des Flaviviridae. Apparenté au virus du Nil occidental et au virus de l'encéphalite de Saint-Louis, il s'agit d'un arbovirus transmis par des moustiques, particulièrement ceux du genre Culex. Chez l'homme, il provoque l'encéphalite japonaise.
Cet article concerne le virus.Pour la maladie provoquée par ce virus, voir Encéphalite japonaise.
Ce virus enveloppé est formé d'une capside à l'intérieur de laquelle se trouve l'ARN viral. Cette capside est recouverte d'une enveloppe virale comprenant des protéines qui jouent le rôle d'antigènes. Cette enveloppe permet au virus de pénétrer dans la cellule hôte. Le génome de ce virus, long d'environ 11 kilobases[2], code une longue polyprotéine clivée en trois protéines structurelles, notées C, prM et E, et sept protéines non structurelles, notées NS1, NS2a, NS2b, NS3, N4a, NS4b et NS5[3]. NS1 est produite sous une forme sécrétée également. NS3 serait une hélicase. NS5 est l'ARN polymérase ARN-dépendante. Ce virus infecte le lumen du réticulum endoplasmique[4],[5], dans lequel de grandes quantités de protéines virales s'accumulent rapidement.
(en) P. A. Desingu, Pradeep K. Ray, Jeny K. John, T. Das, Z. B. Dubal, K. K. Rajak, R. K. Singh et G. Saikumar, «First Complete Genome Sequence of Genotype III Japanese Encephalitis Virus Isolated from a Stillborn Piglet in India», Genome Announcements, vol.5, no3, , e01503-e01516 (PMID28104663, PMCID5255922, DOI10.1128/genomeA.01503-16, lire en ligne)
(en) Li-Juan Xu, Ruixi Liu, Sheng Ye, Hua Ling et Chao-Min Zhu, «Genomic analysis of a newly isolated of Japanese encephalitis virus strain, CQ11-66, from a pediatric patient in China», Virology Journal, vol.10, , p.101 (PMID23548058, PMCID3637482, DOI10.1186/1743-422X-10-101, lire en ligne)
(en) B. He, «Viruses, endoplasmic reticulum stress, and interferon responses», Cell Death & Differentiation, vol.13, no3, , p.393-403 (PMID16397582, DOI10.1038/sj.cdd.4401833, lire en ligne)
(en) Hong-Lin Su, Ching-Len Liao et Yi-Ling Lin, «Japanese Encephalitis Virus Infection Initiates Endoplasmic Reticulum Stress and an Unfolded Protein Response», Journal of Virology, vol.76, no9, , p.4162-4171 (PMID11932381, PMCID155064, DOI10.1128/jvi.76.9.4162-4171.2002, lire en ligne)
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