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Les choano-organismes constituent un taxon d'eucaryotes dont le caractère monophylétique est basé principalement par les analyses moléculaires de l'ARNr 18S.

Choanobionta

Un choanoflagellé

Classification
Domaine	Eukaryota
Sous-domaine	Unikonta
Super-règne	Opisthokonta

Clade

Choanobionta
— auteur incomplet —, date à préciser

Règnes de rang inférieur

Choanomonada
Metazoa

Position phylogénétique

Eukaryota
- Unikonta
  - Amoebozoa
  - Opisthokonta
    - Holomycota
      - Cristidiscoidea
      - Fungi
    - Holozoa
      - Mesomycetozoa
      - Filozoa
        Filasterea
        
        Choanozoa
        Choanoflagellata
        
        Metazoa
- Bikonta

Groupe frère : Filasterea

L'hypothèse de ce regroupement avait autrefois été émise sur la base de la ressemblance entre structures cellulaires des choanoflagellés et celle des choanocytes des éponges, puis abandonné au milieu du XX^e siècle pour son aspect trop simpliste...

La répartition des choano-organismes est mondiale.

Bibliographie

Classification phylogénétique du vivant par Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader aux éditions Belin

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