bio.wikisort.org - Бактерии

Acidobacteria (лат.) — тип бактерий. Представители типа широко распространены и имеют разнообразный метаболизм, особенно много их обнаруживается в почве. Однако лишь немногих представителей удалось культивировать[1][2][3].

Acidobacteria
Представитель рода Acidobacterium
Научная классификация
Домен: Бактерии Тип: Acidobacteria
Международное научное название
Acidobacteria Thrash and Coates 2012
Систематика в Викивидах Изображения на Викискладе ITIS   956098 NCBI   57723 EOL   7916 FW   325146

Первый представитель типа, Acidobacterium capsulatum^[en], был описан в 1991 году[4]. Однако в самостоятельным тип Acidobacteria были выделены лишь в 2012 году[5].

Описание

Acidobacteria физиологически разнообразны и могут встречаться в самых разнообразных местообитаниях: почве (в том числе почвах, загрязнённых металлами), горячих источниках, океанах, пещерах[6]. Многие представители Acidobacteria — ацидофилы, в том числе и первый описанный вид, Acidobacterium capsulatum[7]. Недавно описанные виды типа Acidobacteria: Holophaga foetida^[en][8], Geothrix fermentans^[en][9], Acanthopleuribacter pedis[10] и Bryobacter aggregatus[11] — чрезвычайно многочисленны в почвах, поэтому могут играть важную роль во многих экосистемах[12]. Однако большинство представителей Acidobacteria практически не поддаются культивированию, поэтому их физиология и экология изучены плохо[2]. ДНК двух неклассифицированных бактерий типа Acidobacteria были обнаружены в наборах для выделения ДНК, что могло исказить метагеномные данные и данные о составе микробиоты[13].

Филогения

На следующем филогенетическом дереве представлена филогения Acidobacteria согласно List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[14][15]. Филогенетическое дерево было построено на основе последовательностей 16S рРНК, предоставленных проектом The All-Species Living Tree Project^[en][16].

Acidobacteria

Holophagales Acanthopleuribacteraceae Acanthopleuribacter pedis Fukunaga et al. 2008   Holophagaceae   Geothrix fermentans[en] Coates et al. 1999     Holophaga foetida[en] Liesack et al. 1995         "Solibacteres"   Bryobacter aggregatus Kulichevskaya et al. 2010     Paludibaculum fermentans Kulichevskaya et al. 2014     Acidobacteriaceae[en]     Acidobacterium capsulatum[en] Kishimoto et al. 1991       Telmatobacter bradus Pankratov and Dedysh 2012   Acidicapsa[en]   A. borealis[en] Kulichevskaya et al. 2012 (типовой вид)     A. ligni[en] Kulichevskaya et al. 2012               Bryocella elongata[en] Dedysh et al. 2012   Edaphobacter   E. aggregans Koch et al. 2008 emend. Dedysh et al. 2012     E. modestus[en] Koch et al. 2008 (типовой вид)           "Granulicella" mallensis Männistö et al. 2012     Terriglobus   T. aquaticus Baik et al. 2013       T. roseus Eichorst et al. 2007 (типовой вид)       T. saanensis Männistö et al. 2011     T. tenax Whang et al. 2014         Granulicella     G. cerasi Yamada et al. 2014     G. paludicola Pankratov and Dedysh 2010 (типовой вид)         G. pectinivorans Pankratov and Dedysh 2010       G. sapmiensis Männistö et al. 2012       G. aggregans Pankratov and Dedysh 2010       G. tundricola Männistö et al. 2012       G. arctica Männistö et al. 2012     G. rosea Pankratov and Dedysh 2010

Примечания:
♠ Штаммы, указанные в NCBI, но отсутствующие в LSPN.

Примечания

---