Synechocystis est un genre de cyanobactéries (autrefois appelées algues bleues) représentées en premier lieu par la souche Synechocystissp. PCC6803. Cette dernière vit dans l'eau douce et est capable de se développer à la fois de façon phototrophe par photosynthèse oxygénique et de façon hétérotrophe par glycolyse et phosphorylation oxydative. Elle est capable d'anticiper les transitions jour-nuit à l'aide d'une horloge circadienne.
Les cyanobactéries sont des microorganismes très étudiés du point de vue de la photosynthèse, de la fixation du carbone, de la fixation de l'azote, de l'évolution des plastes des plantes et de l'adaptation au stress environnemental. Synechocystissp. PCC6803 est l'une des espèces de cyanobactéries les plus étudiées, car elle peut pousser à la fois de façon autotrophe et hétérotrophe en l'absence de lumière. Elle a été isolée d'un lac d'eau douce en 1968 et est aisément modifiable par l'ADN exogène. Son génome est réparti sur un chromosome de 3,57 Mb, quatre grands plasmides de 120 106 103 et 44 kbp et trois petits plasmides de 5.2.2.4 et 2,3 kbp[3].
L'appareil photosynthétique de Synechocystis sp. PCC6803 est très semblable à celui des plantes. Cet organisme est également capable de mouvements phototactiques. Il peut vivre dans l'obscurité de façon entièrement hétérotrophe mais, pour une raison encore inconnue, il nécessite d'être exposé à un minimum de 5 à 15 minutes de lumière bleue par jour. Ce rôle régulateur de la lumière demeure inchangé chez les souches dépourvues de photosystème I et de photosystème II[4].
(en) Takakazu Kaneko, Yasukazu Nakamura, Shigemi Sasamoto, Akiko Watanabe, Mitsuyo Kohara, Midori Matsumoto, Sayaka Shimpo, Manabu Yamada et Satoshi Tabata, «Structural Analysis of Four Large Plasmids Harboring in a Unicellular Cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 6803», DNA Research, vol.10, no5, , p.221-228 (lire en ligne) DOI:10.1093/dnares/10.5.221; PMID 14686584
(en) S. L. Anderson et L. McIntosh, «Light-activated heterotrophic growth of the cyanobacterium Synechocystis sp. strain PCC 6803: a blue-light-requiring process», Journal of Bacteriology, vol.173, no9, , p.2761-2767 (PMCID207855, lire en ligne)PMID 1902208
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