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Les Colwellia forment un genre de bactéries à Gram négatif de la famille des Colwelliaceae. Ce sont des bactéries marines de l'embranchement des Pseudomonadota.

Taxonomie

Étymologie

L'étymologie de ce genre est la suivante : Col.well’i.a N.L. fem. n. Colwellia, cette bactérie a été nommée ainsi en honneur de la microbiologiste américaine, le professeur Rita R. Colwell[1]^,[2].

Historique

Le genre Colwellia a été décrit en 1988 après l'isolement d'une bactérie des profondeurs marines[1]. L'analyse de la séquence nucléotidiques de l'ARNr 5S a permis d'identifier une autre bactérie proche mais identifiée auparavant comme Vibrio psychroerythrus. Cela a donné lieu à la création de deux nouvelles espèces, Colwellia psychrerythraea et Colwellia hadaliensis dans ce nouveau genre bactérien et de le classer au sein des Protéobactéries. La famille Colwelliaceae décrite en 2004 a permis de regrouper dans une même famille les genres Colwellia et Thalassomonas du fait de l'homologie de leurs séquences nucléotidiques en ARNr 16S[3]. En 2005, lors de la description de l'ordre Alteromonadales dans le Bergey's Manual, la famille Alteromonadaceae y est intégrée comme unique famille de cet ordre et contenant entre autres les Colwellia[4]. La même année dans la liste des nouveaux noms n°106, les Colwellia sont séparées de cette famille et intégrée dans celle des Colwelliaceae[5].

Liste des espèces

Espèces décrites de manière valide

Selon la LPSN (19 septembre 2022)[6], le genre Colwellia compte 22 espèces publiées de manière valide :

• Colwellia aestuarii depuis 2006 (genre disputé)
• Colwellia agarivorans depuis 2017 (genre disputé)
• Colwellia aquaemaris depuis 2014
• Colwellia arctica depuis 2015
• Colwellia asteriadis depuis 2010
• Colwellia beringensis depuis 2017 (genre disputé)
• Colwellia chukchiensis depuis 2011 (genre disputé)
• Colwellia demingiae depuis 1998. Cette espèce a d'abord été mal nommée comme Colwellia demingae
• Colwellia echini depuis 2019
• Colwellia hadaliensis, depuis 1988
• Colwellia hornerae depuis 1998
• Colwellia marinimaniae depuis 2017
• Colwellia maris depuis 1998
• Colwellia meonggei depuis 2014
• Colwellia mytili depuis 2017 (genre disputé)
• Colwellia piezophila depuis 2004
• Colwellia polaris depuis 2008
• Colwellia ponticola depuis 2019
• Colwellia psychrerythraea, espèce type
• Colwellia psychrotropica, depuis 1998

Espèce publiée de manière non valide

"Candidatus Colwellia aromaticivorans"

Espèces dont le genre est disputé

En 2021, Liu propose de scinder le genre Colwellia en trois genres nommés Colwellia, Cognaticolwellia et Pseudocolwellia[7]. Les espèces suivantes, classées actuellement au sein du genre Colwellia ont été également proposées pour faire partie de ces genres bactériens.

• Genre Cognaticolwellia (décrit en 2021) avec les espèces Cognaticolwellia aestuarii (=Colwellia aestuarii), Cognaticolwellia beringensis (=Colwellia beringensis) et Cognaticolwellia chukchiensis (=Colwellia chukchiensis)
• Genre Pseudocolwellia avec les espèces Pseudocolwellia agarivorans (=Colwellia agarivorans)

Description

Lors de sa description de 2004, la famille Colwelliaceae reprend la description des Colwellia et est composée de bactéries à Gram négatif avec des bacilles à morphologie incurvée et mobiles bien que quelques espèces semblent non mobiles[8]. Ces bacilles ne forment pas d'endospores ni de kystes[8]. La majeure partie des bactéries de cette famille sont des chimioorganotrophes anaérobies facultatifs nécessitant des ions sodium pour leur croissance[8].

Notes et références

Bibliographie

• (en) Jody W. Deming, Leslie K. Somers, William L. Straube, David G. Swartz et Michael T. Macdonell, « Isolation of an Obligately Barophilic Bacterium and Description of a New Genus, Colwellia gen. nov. », Systematic and Applied Microbiology, vol. 10, n^o 2,‎ mars 1988, p. 152-160 (DOI 10.1016/S0723-2020(88)80030-4)
• (en) Elena P. Ivanova, Sébastien Flavier et Richard Christen, « Phylogenetic relationships among marine Alteromonas-like proteobacteria: emended description of the family Alteromonadaceae and proposal of Pseudoalteromonadaceae fam. nov., Colwelliaceae fam. nov., Shewanellaceae fam. nov., Moritellaceae fam. nov., Ferrimonadaceae fam. nov., Idiomarinaceae fam. nov. and Psychromonadaceae fam. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 54, n^o 5,‎ 1^er septembre 2004, p. 1773-1788
• (en) John P. Bowman et Thomas A. McMeekin, « Order X. Alteromonadales ord. nov. », dans Brenner Don J., Krieg Noel R., Staley James T., Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), New York, Springer, 2005, p. 443
• (en) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiology, vol. 70,‎ 2001, p. 10–17 (DOI 10.1023/A:1004876301036)
• (ru) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiologiia, vol. 70,‎ 2001, p. 15-23
• (en) A Liu, YJ Zhang, P Cheng, YJ Peng, J Blom et QJ Xue, « Whole genome analysis calls for a taxonomic rearrangement of the genus Colwellia. », Antonie Van Leeuwenhoek, vol. 113,‎ 2020, p. 919-931 (DOI 10.1007/s10482-020-01405-6)

Liens externes

• Ressources relatives au vivant :
  • Global Biodiversity Information Facility
  • (en) Paleobiology Database
  • (mul + en) iNaturalist
  • (en) Interim Register of Marine and Nonmarine Genera
  • (en) List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
  • (en) Système d'information taxonomique intégré
  • (en) World Register of Marine Species

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