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Acidiferrobacter thiooxydans est l'espèce type d'un genre de bactéries gram négatives, acidophiles, thermotolérantes et anaérobies facultatives appelé Acidiferrobacter. Elles font partie de la famille Acidiferrobacteraceae dans l'ordre Acidiferrobacterales, de l'embranchement des Pseudomonadota.
| Règne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Acidiferrobacterales |
| Famille | Acidiferrobacteraceae |
| Genre | Acidiferrobacter |
Espèce
Taxons de rang inférieur
- Souche type : DSM 2392; JCM 17358; m-1
Taxonomie
Étymologie
La famille Acidiferrobacteraceae a été nommée ainsi d'après le genre type qui lui a été assigné, Acidiferrobacter[2]. L'étymologie de l'espèce Acidiferrobacter thiooxidans est la suivante : thi.o.o.xy’dans Gr. neut. n. theîon, soufre (translitération latine thium); Gr. masc. adj. oxys, acide; N.L. v. oxydo, faire de l'acide, oxyder; N.L. part. adj. thiooxydans, qui oxyde le soufre[1],[3].
Historique
L'espèce Acidiferrobacter thiooxidans a été décrite à partir d'une souche bactérienne dénommée «m-1» et identifiée initialement comme une souche de Thiobacillus ferrooxidans mais dont la phylogénie sur la base de l'ARN ribosomal 16S la positionnait proche des Ectothiorhodospira alcalophile et seulement de manière distante des bactéries du genre Acidithiobacillus capable d'oxyder le fer[1]. Cette espèce et son genre a donc été tout d'abord classé parmi la famille Ectothiorhodospiraceae[1],[4]. De nouvelles études phylogénétiques permettent la création de l'ordre Acidiferrobacterales et de la famille Acidiferrobacteraceae dans lesquels ont été déplacé en les genres Acidiferrobacter et Sulfurifustis[2].
Description
Lors de sa description de , l'espèce Acidiferrobacter thiooxidans comprend des bactéries gram négatives, acidophiles, thermotolérantes et anaérobies facultatives[1]. Ce sont des bactéries autotrophes capables de croître avec l'oxydation des ions ferreux mais aussi par l'oxydation du soufre, du sulfide et du tetrathionate, en utilisant soit l'oxygène soit les ions ferriques comme accepteurs finaux d'électrons. La croissance optimale de cette espèce s'effectue à une température de 38 °C avec un maximum de 47°C caractérisant ainsi sa thermotolérance. La souche type de cette espèce est considérée comme modérément osmophile car elle nécessite un potentiel osmotique extérieur >2 bar avec un optimum à environ 5 bar[1]. Aucune croissance ne se produit lorsque le milieu est à une pression proche de celle de la mer (~26 bar).
La souche type de cette espèce Acidiferrobacter thiooxydans est la souche m-1 déposée dans des banques de cultures bactériennes sous les numéros DSM 2392 et JCM 17358[1]. La souche type m-1 tolère des concentrations élevées de nombreux métaux trouvés habituellement dans les environnements minier[1].
Notes et références
- (en) Kevin B. Hallberg, Sabrina Hedrich et D. Barrie Johnson, « Acidiferrobacter thiooxydans, gen. nov. sp. nov.; an acidophilic, thermo-tolerant, facultatively anaerobic iron- and sulfur-oxidizer of the family Ectothiorhodospiraceae », Extremophiles, vol. 15, , p. 271–279 (DOI 10.1007/s00792-011-0359-2)
- (en) Hisaya Kojima, Arisa Shinohara et Manabu Fukui, « Sulfurifustis variabilis gen. nov., sp. nov., a sulfur oxidizer isolated from a lake, and proposal of Acidiferrobacteraceae fam. nov. and Acidiferrobacterales ord. nov. », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 65, no 10, , p. 3709-3713 (DOI 10.1099/ijsem.0.000479)
- (en) « Species Acidiferrobacter thiooxydans », sur LPSN,
- (en) Pelin Yilmaz, Laura Wegener Parfrey, Pablo Yarza, Jan Gerken, Elmar Pruesse, Christian Quast, Timmy Schweer, Jörg Peplies, Wolfgang Ludwig et Frank Oliver Glöckner, « The SILVA and “all-species living tree project (LTP)” taxonomic frameworks », Nucleic Acids Research, vol. 42, no D1, , D643-D648 (DOI 10.1093/nar/gkt1209)
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :
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