L'exemple du piétin-échaudage illustre la suppressivité des sols, attribuée à la présence de bactéries du sol du sous-groupe Pseudomonas fluorescens, rhizobactéries favorisant la croissance des plantes et qui produisent un antibiotique fongique (le 2,4-diacétylphloroglucinol(en) DAGP) permettant de réguler le piétin-échaudage du blé causé par le champignon Gaeumannomyces graminis[2].
Les souches appartenant à ce sous-groupe sont à Gram négatif (KOH positif), oxydase positive, en forme de bâtonnet. Elle est mobile grâce à ses multiples flagelles. De plus, elle tient la deuxième partie de son nom (fluorescens) du fait qu'elle est fluorescente. Cette fluorescence est due à la production d'un pigment appelé pyoverdine[4]. Sa température de croissance optimale se situe entre 25 et 30 degrés Celsius.
Interactions avec les végétaux
De nombreuses bactéries appartenant à ce sous-groupe bactérien sont retrouvées au niveau de la zone de sol sous l'influence des racines de plantes (rhizosphère). Certaines souches appartenant à ce sous-groupe montrent même des effets bénéfiques pour la plante (suppressivité des sols)[5] et sont alors qualifiées de PGPR (Plant Growth-Promoting Rhizobacteria).
Contamination de produits alimentaires
La contamination de fromages par P. fluorescens est possible, la bactérie étant très présente dans l’environnement des vaches laitières (sol et plantes). Elle a pour conséquence de graves défauts sur les fromages: taches, défauts de goûts, défauts d’aspect des croûtes[6].
Ainsi, en , des consommateurs ont vu leur mozzarella (produite en Allemagne) virer au bleu à l'ouverture de leur sachet. Cette couleur a été attribuée à une contamination par P. fluorescens[7].
Liste de souches appartenant à ce sous-groupe bactérien
(en) Roeland L Berendsen, Corné M J Pieterse, Peter A H M Bakker, «The rhizosphere microbiome and plant health», Trends Plant Sci, vol.17, no8, , p.478-486 (DOI10.1016/j.tplants.2012.04.001).
(en) Magdalena Mulet, Jorge Lalucat et Elena García-Valdés, «DNA sequence-based analysis of the Pseudomonas species», Environmental Microbiology, vol.12, , p.1513-1530 (ISSN1462-2920, DOI10.1111/j.1462-2920.2010.02181.x, lire en ligne, consulté le )
(en) Adela M. Luján, Pedro Gómez et Angus Buckling, «Siderophore cooperation of the bacterium Pseudomonas fluorescens in soil», Biology Letters, vol.11, , p.20140934 (ISSN1744-9561 et 1744-957X, PMID25694506, PMCID4360104, DOI10.1098/rsbl.2014.0934, lire en ligne, consulté le )
Joyce E. Loper, Karl A. Hassan, Dmitri V. Mavrodi et Edward W. , II Davis, «Comparative Genomics of Plant-Associated Pseudomonas spp.: Insights into Diversity and Inheritance of Traits Involved in Multitrophic Interactions», PLoS Genet, vol.8, , e1002784 (PMID22792073, PMCID3390384, DOI10.1371/journal.pgen.1002784, lire en ligne, consulté le )
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