Le analisi cladistiche indicano che questo piccolo essere era un antico membro degli agnati (un parente o un antenato dell'odierna lampreda) oppure forse già un pesce primitivo, il più antico del gruppo[1].
Lungo circa 3 cm e piatto come il Myllokunmingia, altro pesce primitivo, è stato trovato, come dice lo stesso nome, a Ercaicun presso Haikou (prefettura di Kunming, Yunnan, Cina)[2].
La sua testa aveva dalle sei alle più probabili nove branchie e possedeva probabilmente una notocorda. Era munito di pinne ventrali e caudali, anche se quest'ultima è scomparsa dai fossili[3]. Non ci sono segni di mineralizzazione sugli scheletri.
L'Haikouichthys nei media
L'Haikouichthys compare in L'impero dei mostri - La vita prima dei dinosauri, mentre infastidisce insieme ad altri suoi simili un Anomalocaris ferito.
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